Broj vrsta bakterija u majčinom mleku varira - manji je kod trudnica koje su ranije bile gojazne, ili su se u trudnoći ugojile više nego što je preporučljivo. Španski naučnici su u toku svoje studije došli do podataka da majke kojima je unapred zakazan porođaj carskim rezom imaju manje vrsta bakterija u mleku, dok je kod žena koje su imale neplanirani carski rez taj broj isti kao kod onih koje su se porodile prirodnim putem. Raul Kabrera-Rubio i njegove kolege istraživači, došli su do zaključka da na razvovrsnost bakterija u majčinomo mleku utiče nivo hormona u toku porođaja.
Humano mleko igra važnu ulogu u formiranju bakterijske flore sistema za varenje deteta. Naučnici imaju u planu da ispitaju da li bakterije u majčinom mleku pomažu bebinom varenju, ili samo podstiču njen imuni sistem.